Bifidobacterium dapat secara efektif menghambat pembusukan umum dan bakteri suhu - rendah. Efek antibakteri terutama melalui persaingan situs nutrisi dan adhesi, produksi zat antibakteri, dan penguatan kekebalan tubuh. Ini memiliki efek pada adhesi dan reproduksi bakteri patogen usus. Untuk antagonisme dan menghalangi patogenesis penyakit. Zat antibakteri yang diproduksi oleh bifidobacteria terutama asam organik, bakteriokin, bakteriokin dan zat antibakteri lainnya.
Volatile pendek - asam lemak rantai seperti asam laktat dan asam asetat, yang merupakan metabolit bifidobacteria, meningkatkan konsentrasi ion hidrogen di lingkungan, yang lebih tinggi dari konsentrasi ion hidrogen dalam sel bakteri patogen. Ion hidrogen menembus ke dalam sel bakteri patogen untuk membuatnya pengasaman sitoplasma mempengaruhi pertumbuhannya dan bahkan menonaktifkan bakteri patogen untuk mencapai efek antibakteri.
Studi telah menunjukkan bahwa kaldu fermentasi bifidobacteria memiliki efek antibakteri yang jelas secara in vitro, dan pH rendah adalah kondisi penting untuk efek antibakteri. Selain itu, beberapa bifidobacteria dapat memetabolisme untuk menghasilkan protein yang disintesis oleh ribosom dengan efek antibakteri, yang disebut racun bakteri, yang dapat menghambat pertumbuhan bakteri patogen lainnya.